Tietojen päällekkäisyys
Toinen haaste on koulutus ja käyttäjien omaksuminen. Työntekijöiden sopeutuminen useisiin ohjelmistojärjestelmiin, käyttöliittymiin ja työnkulkuihin voi olla aikaa vievää ja haastavaa. Lisäksi tietojen päällekkäisyys on suuri ongelma. Tietojen päällekkäisyyttä voi esiintyä, kun eri järjestelmät tallentavat samankaltaisia tietoja. Tämä johtaa tehottomuuteen ja mahdollisiin ristiriitoihin.
Reaaliaikaiset päivitykset ovat ratkaisevan tärkeitä valmistuksessa, mutta erilliset järjestelmät eivät aina tarjoa tätä ominaisuutta. Tämä rajoitus voi haitata päätöksentekoa ja reagointikykyä. Myös skaalautuvuus on ongelma. Kun organisaatio laajenee, erilliset järjestelmät eivät pysty skaalautumaan tehokkaasti, mikä häiritsee tietojen yhdenmukaisuutta.
Valmistajariippuvuudesta voi tulla merkittävä haitta. Organisaatiot voivat joutua riippuvaisiksi useista ohjelmistotoimittajista, joilla kullakin on erilaiset lisenssiehdot ja tukivaatimukset. Tämä riippuvuus voi rajoittaa joustavuutta.
Lisäksi useiden järjestelmien hallinnointi ja ylläpito on aikaa ja resursseja vievää. Se edellyttää huolellista huomiota ohjelmistopäivityksiin, korjauksiin ja vikakorjauksiin jokaisessa yksittäisessä järjestelmässä. Myös yhteensopivuusongelmia voi ilmetä. Yhden järjestelmän muutokset tai päivitykset eivät välttämättä sovi yhteen muiden järjestelmien kanssa, mikä voi johtaa mahdollisiin käyttökatkoksiin.